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抗擊”新型肺炎！阿里達(dá)摩院研發(fā)AI算法，半小時(shí)完成疑似病例基因分析
2020-02-05 14:21 作者：ylh 瀏覽量：
這次的肺炎疫情對(duì)中國的中小企業(yè)將會(huì)是沉重的打擊，據(jù)釘釘和微信兩個(gè)辦公平臺(tái)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)現(xiàn)有2億左右的人在家遠(yuǎn)程辦公，那么對(duì)于中小企業(yè)的員工來說不懂IT技術(shù)將會(huì)讓他們面臨的最大挑戰(zhàn)和困難。
電腦不亮了怎么辦？系統(tǒng)藍(lán)屏如何處理？辦公室的電腦在家如何連接？網(wǎng)絡(luò)應(yīng)該如何設(shè)置？VPN如何搭建？數(shù)據(jù)如何對(duì)接？服務(wù)器如何登錄？數(shù)據(jù)安全如何保證？數(shù)據(jù)如何存儲(chǔ)？視頻會(huì)議如何搭建？業(yè)務(wù)系統(tǒng)如何開啟等等一系列的問題，都會(huì)困擾著并非技術(shù)出身的您。
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利用技術(shù)輔助抗擊疫情，阿里巴巴、百度等科技巨頭各顯身手。
此前，AI科技大本營采訪報(bào)道了阿里達(dá)摩院《數(shù)十名工程師作戰(zhàn)5天，阿里達(dá)摩院連夜研發(fā)智能疫情機(jī)器人》一文，后者為了解決客服人力不足的局面，快速響應(yīng)政府需求開發(fā)相應(yīng)產(chǎn)品。
1月29日，阿里云宣布開放一切AI算力，將與合作機(jī)構(gòu)向全球科學(xué)共同體免費(fèi)開放相關(guān)藥物研發(fā)資源，共同加速針對(duì)新型冠狀病毒的藥物研發(fā)。
基于阿里云提供的強(qiáng)大AI算力，可以幫助科研機(jī)構(gòu)縮短研發(fā)周期，支持病毒基因測序、新藥研發(fā)、蛋白篩選等工作。
很快，新成果再度宣布。2月1日，由浙江省疾病預(yù)防控制中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊(duì)和杰毅生物技術(shù)公司共同研發(fā)的自動(dòng)化的全基因組檢測分析平臺(tái)上線浙江省疾控中心，該平臺(tái)將在浙江大規(guī)模應(yīng)用。
其中，針對(duì)新型冠狀病毒的AI診斷技術(shù)，阿里達(dá)摩院研發(fā)了AI算法，可將原來數(shù)小時(shí)的疑似病例基因分析縮短至半小時(shí)，大幅縮短確診時(shí)間，并能精準(zhǔn)檢測出病毒的變異情況。當(dāng)然，該平臺(tái)同樣有基于阿里云的算力為病毒解析提供支撐。
公開信息顯示，該病毒是基因組序列最長的病毒之一，全基因組序列全長29847bp，臨床診斷需要將患者樣本與該病毒基因序列進(jìn)行比對(duì)才能確定診斷結(jié)果。
另一方面，根據(jù)阿里方面提供的資料，目前醫(yī)院普遍采用核酸檢測方法，其只能檢測到病毒基因的局部。而由于病毒存在變異的可能性，對(duì)于整個(gè)基因序列來說這種檢測方法猶如盲人摸象，一旦病毒發(fā)生變異，就可能出現(xiàn)漏檢的情況。
當(dāng)前，全國新型冠狀病毒肺炎疫情依然嚴(yán)峻，快速、精確診斷對(duì)于疫情控制尤其重要。
而此次研發(fā)的自動(dòng)化全基因組檢測分析平臺(tái)采用不同于核酸檢測方法的全基因組檢測技術(shù)，對(duì)疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列分析比對(duì)，能夠有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢，并將原需數(shù)小時(shí)的全基因分析流程減少到半小時(shí)，大幅提高疑似病例的確診速度和準(zhǔn)確率。
阿里方面稱，疫情發(fā)生后，達(dá)摩院算法專家顧斐博士第一時(shí)間針對(duì)新型冠狀病毒基因進(jìn)行特征分析，并推出多個(gè)算法模型。在序列比對(duì)過程中，達(dá)摩院對(duì)算法增加了分布式設(shè)計(jì)，有效提升比對(duì)效率；在病毒序列拼接階段使用分布式設(shè)計(jì)的de Bruijn圖算法，變異病毒也能精準(zhǔn)檢測。
浙江省疾控中心基因測序負(fù)責(zé)人孫逸博士表示，基于該平臺(tái)，未來還可以在短時(shí)間內(nèi)將檢測范圍覆蓋整個(gè)確診病例，也為后續(xù)疫苗與藥物研發(fā)打下基礎(chǔ)。
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